IPGimnaziul Pruteni îşi propune următoarele direcţii strategice de activitate pe termen mediu:
1. Asigurarea condiţiilor necesare  pentru extinderea accesului la educaţia de bază;
2. Promovarea educaţiei incluzive şi dezvoltarea alternativelor educaţionale;
3. Eficientizarea procedurii de organizare şi desfăşurare a evaluărilor  rezultatelor şcolare: primar, gimnazial;

4. Implementarea Tehnologiilor Informaţionale şi Comunicaţionale în educaţie

În anul şcolar 2015 – 2016 IP Gimnaziul Pruteni îşi va axa activitatea pe genericul „ Acces, relevanţă, calitate în educaţie – competenţe pentru prezent şi viitor”